Les restes de matèria orgànica són de llarg la fracció de la recollida selectiva de la qual se'n fan més tones a Sant Joan de les Abadesses. En concret, representa quasi la meitat de la selecció, amb un 47,3 per cent del total. La resta de matèries seleccionades estan a molta més distància i es mouen entre el 18 per cent i l'11 per cent. Així, del paper i cartró, el volum recollit és del 18,3 per cent del total, seguit del vidre, amb un 11,40 per cent, i dels envasos lleugers, amb un 11,35 per cent. La resta per fer el total, l'11,51 per cent, és la matèria de rebuig.

A part, la deixalleria recull tòners, residus voluminosos, estris de cuina i altres, i, a Sant Joan, hi ha dos punts de recollida dels anomenats Roba Amiga al pla del Roser i al pavelló, i un punt de recollida de piles i tòners al punt d'informació ambiental de l'Ajuntament. Els residus reciclats van a parar a Berga, si són envasos; a Olot, si és matèria orgànica; a Orís, si és rebuig; a Sarrià de Ter i sobretot a Gurb, si és paper; i a Mollet del Vallès, en el cas de vidre.

La recollida porta a porta es fa a diari a partir de les vuit del vespre. Els dilluns es recull el rebuig i cada dilluns primer de mes, l'oli; els dimarts, envasos; els dimecres, la matèria orgànica; els dijous, paper i cartró; els divendres, orgànica i vidre; els dissabtes, envasos; els diumenges, matèria orgànica; i la recollida dels voluminosos és setmanal.