Els Acords de Schengen van ser signats en aquesta ciutat de Luxemburg, el 1985 i 1990, i l'objectiu principal va ser suprimir de forma progressiva els controls fronterers en els països de la Unió Europea per garantir la lliure circulació de béns, serveis, capitals, treballadors i viatgers. L'espai Schengen, en matèria de seguretat, va entrar en vigor el 1995 a Espanya, França, Alemanya, Bèlgica, Itàlia, Luxemburg, els Països Baixos i Portugal i això significava la desaparició de les policies a les fronteres. Posteriorment, s'hi han anat afegint altres estats, la majoria de la Unió Europea –tots menys el Regne Unit i la República d'Irlanda, que només hi participen parcialment–, a més d'Islàndia, Liechtenstein, Noruega i Suïssa. Els darrers a incorporar-se han estat països de l'Europa de l'Est com Estònia, Letònia, Lituània, la República Txeca, Hongria, Malta, Polònia, Eslovàquia i Eslovènia. El resultat és un espai sense fronteres de 3,6 milions de quilòmetres quadrats i més de 400 milions de ciutadans.

Al pas transfronterer de pont del Rei, a Canejan (Val d'Aran), l'antiga duana s'ha reconvertit en un anomenat «centre de cooperació policial» entre cinc cossos policials dels dos costats de la frontera: Mossos d'Esquadra, Guàrdia Civil, Cuerpo Nacional de Policía, Gendarmeria Francesa i la policia duanera de França. El centre ocupa una antiga instal·lació duanera situada seguint el curs dela carretera N-230, però ja en territori de l'Estat francès i sense interrompre el trànsit. No hi ha cabines, sinó un edifici al costat de la carretera. Des d'aquest centre, els diversos cossos policials intercanvien informacions relatives a estrangeria o seguretat ciutadana, però sense aturar els vehicles llevat que es realitzin controls policials esporàdics per algun motiu concret. «És tracta més aviat d'un centre de recollida i d'intercanvi de dades», expliquen des de la subdelegació del govern de l'Estat a Lleida, de la qual depèn aquest centre. Els controls antiterroristes són una altra de les funcions d'aquest centre. Són controls puntuals, de curta durada, en punts indeterminats de la carretera i realitzats per agents aliens al dispositiu habitual del centre Pont de Rei.

Fa sis anys, el 2003, es van enderrocar les quatre cabines policials i la marquesina que hi havia a la sortida de la Jonquera, a la zona duanera on es col·locaven agents de la Guàrdia Civil per controlar el contraban i el pas de mercaderies. Les cabines estaven situades enmig de l'N-II, a tocar de les antigues agències, i el fet de quedar en desús va provocar que es degradessin. Estaven en molt mal estat i brutes, fins que Foment, deu anys després de l'entrada en vigor dels Acords de Schengen, va retirar-les aprofitant una reforma que es va fer a la carretera. Feia temps que l'Ajuntament de la Jonquera reclamava l'enderroc, per la mala imatge que provocaven a causa de l'estat d'abandó. També intervencions de grups parlamentaris anaven en la mateixa línia. La imatge que oferien les instal·lacions dels antics passos fronterers de Portbou, la Jonquera, coll d'Ares i Puigcerdà era lamentable. Amb edificis bruts, destrossats, plens de pintades i amb les estructures metàl·liques ben rovellades. El mes de gener del 2003, el que en aquells moments era ministre d'Interior del govern espanyol, Mariano Rajoy, donava la raó al que en aquell moment era senador de CiU, el garrotxí Jordi Xuclà, que, en diferents intervencions, havia reclamat una solució per a aquests espais. Aquell any, el govern espanyol va intervenir-hi definitivament i es van eliminar, a través del pressupost del Ministeri de Foment, pràcticament totes les instal·lacions, sobretot les situades enmig de la carretera, com eren les cabines de la Jonquera. Tot i que es van treure les cabines, es van deixar les illetes on estaven col·locades, i no va ser fins fa tres anys, aprofitant que Foment feia una altra reforma a l'N-II, que es van eliminar aquests elements i es va deixar neta tota la calçada.