Els usos que tindran les línies de llum de sincrotró seran força variats, ja que abracen diferents camps de recerca, des de la indústria alimentària fins a la cosmètica, passant per la indústria tèxtil i la farmacèutica. Es pot fer servir per fabricar objectes molt petits, com ara els que fabriquen les empreses d'ordinadors, i també per dissenyar fàrmacs. És en el camp de la biologia molecular que la llum de sincrotró té un impacte més gran, ja que permet l'estudi en profunditat de proteïnes i virus. També es pot aplicar en teràpia mèdica, en ciències ambientals, per conèixer l'estructura dels contaminants, i en ciències dels materials, per estudiar les seves propietats. La resolució d'una estructura necessitava anys de treball, i ara la llum de sincrotró permet fer-ho, de manera quasi rutinària, en qüestió d'hores. Hi ha reptes que el sincrotró podrà assumir, però, això sí, amb recerca i treball. El director del sincrotró, Joan Bordas, n'apunta algun: «Treballar estructures de material biològic sense necessitat de cristal·litzar, sense manipulació; sobre el paper es possible, però a la pràctica ningú no ho ha fet.»