El govern de l'Estat i les forces polítiques i socials han condemnat de forma generalitzada l'atac israelià contra la flota de vaixells amb ajuda humanitària que anava a Gaza.

El govern espanyol, per mitjà d'un comunicat del Ministeri d'Afers estrangers, ha qualificat l'acció militar israeliana com una "actuació completament desproporcionada" i ha convocat l'ambaixador d'Israel a Madrid, Rafael Schultz, per transmetre-li l'"enèrgica" protesta de l'Estat espanyol. Per la seva banda, el president José Luis Rodríguez Zapatero ha definit l'atac israelià com "fets greus i preocupants".

En el Congrés, diputats de totes les forces polítiques amb representació parlamentària agrupats en l'intergrup per Palestina han condemnat de forma conjunta la "brutal agressió" d'Israel en un atac que vulnera les lleis internacionals per anar contra "civils desarmats".

La diputada del PSOE Elena Valenciano també ha condemnat l'inadmissible" atac israelià. El vicesecretari de comunicació del PP, Esteban González Pons, ha "lamentat i condemnat els danys causats" després d'afirmat que l'ús de la violència no està mai justificat. Pel diputat d'IU Gaspar Llamazares l'acció israeliana és un "crim contra la humanitat" que hauria de fer que l'Estat i la UE "suspenguin" qualsevol tipus de relació preferent amb Israel. Per la seva banda, el coordinador general d'Izquierda Unida, Cayo Lara, ha exigit una resposta internacional "contundent".

Amnistia Internacional ha exigit a Israel una investigació "immediata, creïble i independent", després d'afirmar que "no resulta creïble" que hi hagués justificació per a l'ús d'armes mortals. També, diverses ONG han assenyalat que l'agressió ha estat "intolerable i inacceptable"contra activistes "pacífics" que "no estan armats i són la veu de la pau".

El president de l'ONG Cultura, Paz y Solidaridad, Manuel Espinar, pare d'un dels cooperants espanyols que anava en l'expedició a Gaza, ha manifestat que el govern espanyol i la UE són "culpables" del que ha passat i ha demanat la retirada de l'ambaixador espanyol a Israel.

Justificació diplomàtica
L'ambaixador israelià a Madrid ha al·legat que els soldats havien actuat en "defensa pròpia" i que l'acció militar responia a una "provocació violenta, motivada políticament amb elements radicals amb vincles amb el món musulmà com Al Qaida i el jihadisme".