Salut

IrsiCaixa desenvolupa un web per seguir les variants del coronavirus a l’estat espanyol

L’eina CovidTag és oberta i quantifica les mostres seqüenciades per territori

L’Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa ha creat una pàgina web amb informació de l’evolució de les variants del coronavirus a l’estat espanyol. L’eina, anomenada CovidTag, és oberta i permet obtenir el número total de mostres seqüenciades a cada regió. Així, es veu com Navarra és la comunitat autònoma que més mostres està seqüenciant per habitant i com Catalunya és la regió amb més mostres totals seqüenciades. “L’objectiu d’aquesta pàgina web és compartir amb tothom i en directe la situació actual de la pandèmia a l’estat espanyol i fer un seguiment geogràfic de les variants que van apareixent”, afirma Marc Noguera-Julian, investigador associat a IrsiCaixa i cocreador de CovidTag (http://covidtag.paseq.org/).

L’actualització setmanal de la informació és possible gràcies a la base de dades de GISAID, una plataforma que ofereix dades genòmiques globals relacionades amb el coronavirus.

“La quantitat de mostres seqüenciades pot ser molt dispar entre comunitats autònomes, i això cal tenir-ho present a l’hora d’interpretar les freqüències de les variants a cada regió”, apunta Francesc Català, data engineer a IrsiCaixa i cocreador de CovidTag. “Com més mostres hagi seqüenciat una comunitat autònoma, més representativa serà la prevalença de cada variant en aquell territori”, aclareix.

L’eina mostra com les noves variants van desplaçant les anteriors. Actualment, per exemple, la variant B.1.177, la predominant al llarg del 2020, ha perdut terreny mentre la variant B.1.1.7, l’anomenada ‘variant britànica’.

CovidTag vol ser una eina útil per al personal sanitari i investigador a l’hora d’implementar estratègies de prevenció i dissenyar estudis, respectivament, però també per a la població general interessada a fer un seguiment actualitzat de les variants.

“Una de les coses que ens ha ensenyat aquesta pandèmia és la necessitat de prendre mesures de restricció a temps per tal de mantenir el virus a ratlla i evitar al màxim l’aparició de noves variants”, indica Roger Paredes, investigador principal a IrsiCaixa, centre impulsat conjuntament per la Fundació La Caixa i el Departament de Salut.



Identificar-me. Si ja sou usuari verificat, us heu d'identificar. Vull ser usuari verificat. Per escriure un comentari cal ser usuari verificat.
Nota: Per aportar comentaris al web és indispensable ser usuari verificat i acceptar les Normes de Participació.

El Maresme obrirà les platges per Sant Joan i reforçarà la vigilància per evitar aglomeracions

Mataró

93 denúncies per delictes d’odi contra el col·lectiu LGTBI en el primer trimestre de l’any

Barcelona

L’Hospitalet de Llobregat comença la retirada de les plaques franquistes dels 200 edificis que encara les conserven

L’Hospitalet de Llobregat

Els pastissers confien vendre 1,8 milions de coques de Sant Joan i aposten per mides més grans

Castellterçol

Les UCI s’alleugereixen amb 21 pacients menys

Barcelona

La 6/49 reparteix el premi més gran de la seva història: 14.809.871 € a un únic encertant a Caldes de Montbui

Barcelona

Mor el conductor d’un tractor en un accident aquesta nit a la carretera de Santa Engràcia de Tremp

Barcelona

Pugen a 244 els grups escolars confinats, 11 més

Barcelona

Activat el Pla Inuncat per previsió de fortes pluges a la meitat de Catalunya 

Barcelona